云南大學中國經濟史研究所成立于2000年1月，其前身為1982年李埏先生創建的中國封建經濟史研究室。林文勛教授為研究所第一任所長，李埏先生為名譽所長。其后，吳曉亮教授、黃純艷教授先后擔任研究所所長。
中國經濟史學科，即專門史（經濟史）1981年獲碩士學位授權，1986年獲博士學位授權，1986年被評為云南省重點學科。2007年中國經濟史學科作為重要支撐的專門史被評為國家重點學科。研究所目前有專兼職教授9人，副教授3人，講師1人，其中博士生導師5人，碩士生導師10人，是一支年齡結構合理、職稱結構優化，具有很強創新能力和開拓精神的教學科研隊伍。
研究所在開創者李埏先生的引領指導下，在中國商品經濟史、土地制度史、唐宋史、云南地方經濟史和中國經濟思想史等研究領域形成了鮮明的學術特色，取得了豐富的研究成果，樹立了良好的學術聲譽。研究所主持出版了“云南大學中國經濟史研究叢書”、“云南大學宋史研究叢書”、“云南大學云南地方經濟史研究叢書”，三套叢書共出版著作24種。已出版其他研究著作數十部，發表論文數百篇。研究所成員目前主持國家社科基金重大項目2項、一般項目（含西部項目和青年項目）10項、其他省部級研究項目多項。研究論著榮獲全國高等學?？茖W研究優秀成果獎，入選國家哲學社會科學優秀成果文庫，多次獲得云南省哲學社會科學優秀成果一等、二等獎。
研究所主持開設了云南大學第一門研究生慕課課程，集合北京大學、清華大學、武漢大學、中山大學、廈門大學、臺灣大學、中正大學等高校和研究機構一流的中國經濟史學者共同講授“中國經濟史研究的理論與方法”。該課程榮獲云南大學教學優秀成果特等獎。
截至2020年6月，研究所已培養博士83人，碩士近200人。目前在讀碩士研究生36人，博士研究生23人。
林文勛，歷史學博士、教授，博士生導師，主要從事唐宋經濟史、鄉村社會史、中國邊疆史地研究。
吳曉亮，歷史學博士、教授，博士生導師，主要從事宋代經濟史、城市史、契約文書整理與研究。
張錦鵬，歷史學博士、研究員，博士生導師，主要從事宋代經濟史、商品經濟史、民族經濟史研究。
薛政超，歷史學博士、教授，博士生導師，主要從事唐宋經濟史研究。
王文成，歷史學博士、研究員，碩士生導師，主要從事中國古代貨幣經濟史、云南地方經濟史研究。
廖國強，歷史學碩士、編審，碩士生導師，主要從事云南地方史研究。
戴順祥，歷史學博士、教授，碩士生導師，主要從事唐宋經濟史研究。
趙小平，歷史學博士、教授，碩士生導師，主要從事中國鹽業史、貨幣史、云南地方經濟史研究。
田曉忠，歷史學博士、副教授，碩士生導師，主要從事唐宋社會經濟史研究。
黎志剛，歷史學博士、副教授，碩士生導師，主要從事宋代經濟史、鄉村社會史研究。
董雁偉，歷史學博士、講師，碩士生導師，主要從事明清社會經濟史、中國古代文化史、云南地方經濟社會研究。
李園，歷史學博士、副教授，碩士生導師，主要從事明清財政史研究。